设立农民专业合作社,应当向工商行政管理部门提交文件,申请设立登记
农民专业合作社是以农村家庭承包经营为基础，通过提供农产品的销售、加工、运输、贮藏以及与农业生产经营有关的技术、信息等服务来实现成员互助目的的组织，从成立开始就具有经济互助性。拥有一定组织架构，成员享有一定权利，同时负有一定责任。
自愿、自治和民治管理是合作社制度最基本的特征。合作社作为一种独特的经济组织形式，其内部制度与公司型企业相比有着本质区别。股份公司制度的本质特征是建立在企业利润基础上的资本联合，目的是追求利润的最大化，"资本量"的多寡直接决定盈余分配情况。在合作社内部，起决定作用的不是成员在合作社中"股金"，而是"交易"。合作社的主要功能是为社员提供交易上所需的服务。合作社与社员的交易不以盈利为目的。合作社的盈余，除了一小部分留作公共积累外，大部分要根据社员与合作社发生的交易额的多少进行分配。实行按股分红与按交易额分红相结合，以按交易额分红为主，是合作社分配制度的基本特征。当然，合作社与其他经济主体的交易也会也是以营利为目的的。
(1)组织上
在组织构成上，合作社以农民作为经济主体，主要由进行同类农产品生产、销售等环节的公民、企业、事业单位联合而成，农民至少占成员总人数的百分之八十，从而构建了新的组织形式;
(2)在所有制结构上
合作社在不改变家庭承包经营的基础上，实现了劳动和资本的联合，从而形成了新的所有制结构;
(3)在收益分配上
合作社对内部成员不以盈利为目的，将利润返还给成员，从而形成了新的收益分配制度;
(4)在管理机制上
合作社实行入社自愿，退社自由，民主选举，民主决策等原则，建构了新的经营管理。
法律依据：
《中华人民共和国农民专业合作社法》第十二条设立农民专业合作社，应当具备下列条件：
（一）有五名以上符合本法第十九条、第二十条规定的成员；
（二）有符合本法规定的章程；
（三）有符合本法规定的组织机构；
（四）有符合法律、行规规定的名称和章程确定的住所；
（五）有符合章程规定的成员出资。